Kariyerine 2005-2006 sezonunda Detroit Jesuit Üniversitesi’nde başlayan Morgan ilk sezonunda 10.5 sayı ve 6.5 ribaunt ortalamaları ile oynadı. Bir sonraki sezon yine aynı takımla mücadele eden Jordan, 13 sayı ve 10 ribaunt ortalamaları ile sezonu double-double ile tamamladı. Morgan Detroit’teki son sezonunda ise 20 sayı ve 14 ribaunt ortalaması ile oldukça iyi bir performans gösterdi.

2009-2010 sezonu başında NCAA takımlarından Michigan’a geçen Jordan Morgan ilk sezonunda 35 karşılaşmaya çıkarak 9.2 sayı ve 5.4 ribaunt ortalaması ile oynadı. 2011-2012 sezonunda oynadığı 34 karşılaşmada 7.3 sayı ve 5.6 ribaunt ortalaması yakaladı. Jordan Michigan’daki üçüncü sezonunda ise 4.6 sayı ve 4.3 ribaunt ortalaması yakaladı. 2013-2014 sezonunda 37 karşılaşmaya çıkan Morgan, sezonu 6.4 sayı ile 5 ribaunt ortalamasıyla tamamlayarak %70 isabetli şut yüzdesi yakaladı ve Avrupa takımlarının dikkatini çekti.

2014-2015 sezonu başında İtalya’nın Virtus Acea Roma takımına transfer olarak profesyonel kariyerine başlayan Jordan Morgan, o sezon 24 karşılaşmada 7.5 sayı ve 6 ribaunt ortalamaları ile mücadele etti. Takımı ile birlikte 18 Eurocup maçına da çıkan Morgan, 9.1 sayı ve 6.7 ribaunt ortalaması ile oldukça başarılı bir sezonu geride bırakmış oldu.

2015 Temmuz ayında NBA Pro Yaz Ligi’nde Orlando Blue ile 4 maça çıkan Morgan, 4.5 sayı ve 4.3 ribaunt ortalamaları ile mücadele etti. Aynı yaz Minnesota Timberwolves ile de 3 maça çıkan Amerikalı oyuncu, 2.7 sayı ve 3.3 ribaunt ortalaması yakaladı.

2015-2016 sezonu başında Fransa B Ligi takımlarından Hermine Nantes Atlantique takımına transfer olan Jordan, burada ligin ilk devresinde 14 maça çıktı ve 9.3 sayı ile 5.8 ribaunt istatistiklerini yakaladı. Gösterdiği iyi performansla ikinci devre başında Fransa A Ligi takımlarından Paris Levallois’e transfer olan Morgan, Paris’te de 7 maça çıkarak 5.6 sayı ve 5.6 ribaunt ortalamalarını yakaladı.

2016-2017 sezonu başında Yunanistan’ın GS Kymis takımına transfer olan Amerikalı oyuncu burada 11 maça çıkarak 11.6 sayı ve 9 ribaunt ortalamaları tutturdu.

Jordan Morgan geçtiğimiz sezon Banvit’in de FIBA Şampiyonlar Ligi’nde gruplardaki rakiplerinden Slovenya temsilcisi Petrol Olimpija Ljublaja’ya transfer oldu. Slovenya’da takımı ile birlikte 33 maça çıkan Morgan, 13.7 sayı ve 6.7 ribaunt ortalamaları ile mücadele ederken, aynı zamanda Adriyatik Ligi’nde de 22 maça çıkarak 15 sayı ve 7.2 ribaunt ortalamalarını yakaladı. Jordan Adriyatik Ligi’nde sezon boyunca en çok ribaunt alan dördüncü oyuncu oldu. FIBA Şampiyonlar Ligi’nde de 14 maça çıkan Amerikalı oyuncu, 15.6 sayı ve 8 ribaunt ortalaması ile başarılı bir sezonu geride bıraktı. FIBA Şampiyonlar Ligi’nde 8 ribaunt ortalaması ile en çok ribaunt alan üçüncü oyuncu olan Jordan aynı zamanda 19.3 verimlilik puanı ile sezonun en değerli ve verimli ikinci oyuncusu oldu. Amerikalı oyuncu yeni sezonda Turuncu-Yeşilli formanın başarısı için mücadele edecek.