Denizli doğumlu olan Atakan Üner, futbolculuk kariyerine Denizlispor altyapısında başladıktan sonra Altınordu'ya transfer olmuş ve burada gösterdiği performansla dikkatleri üzerine çekmiştir.
2018/2019 sezonunda Altınordu'dan Beşiktaş'a 6 milyon TL karşılığında transfer olan Atakan, Süper Lig'de Beşiktaş formasıyla şans bulamamış ve ardından Ümraniyespor'a kiralanmıştır.
Beşiktaş'ta tutunamayan Atakan, sırasıyla Tuzlaspor, Afyonspor, Düzcespor ve Menemen FK takımlarında kiralık olarak forma giymiştir. Ancak, bu kulüplerde de süre bulamayan genç oyuncu, 2024/2025 sezonunda Menemen FK'da hiç forma şansı bulamamış ve kulüple yolları ayrılmıştır. Şu an itibarıyla kulüpsüz olan Hüseyin Atakan Üner'in yeni sezon öncesi hangi takımla anlaşacağı merak konusu olmuştur.
Atakan Üner, kariyerinde 2. Lig'de 30 maçta 4 gol atarken, Süper Lig'de Beşiktaş formasıyla 6 maçta 1 gol kaydetmiştir.Genç yaşta büyük kulüplerde forma giyme fırsatı bulan Atakan, henüz 25 yaşında ve futbolculuk kariyerine devam etmeyi hedeflemektedir.
Atakan Üner'in geleceği, performansını sergileyebileceği ve süre bulabileceği bir kulüpte yeniden şekillenecektir.Futbolseverler, genç oyuncunun kariyerindeki yeni adımı merakla beklemektedir.
